متخصص علم داده · پژوهش بالینی · برگامو، ایتالیا
رسول سامعی
در مؤسسه ماریو نگری روی دادههای بالینی بخش مراقبتهای ویژه کار میکنم. بخش مهمی از کارم یکپارچهسازی و آمادهسازی پایگاههای دادهی پراکنده است تا بتوان از آنها برای تحلیل و پاسخ به پرسشهای پژوهشی استفاده کرد.
در حال حاضر بهدنبال فرصت دکتری یا موقعیت پژوهشی در حوزهی دادههای سلامت هستم.
درباره من
متخصص علم داده در حوزهی پژوهشهای بالینی هستم و از نوامبر ۲۰۲۴ در مؤسسه تحقیقات داروشناسی ماریو نگری در رانیکا فعالیت میکنم. تمرکز اصلی کارم بر دادههای مراقبتهای ویژه است: پایگاههای دادهی بالینی پراکنده را یکپارچه میکنم، جداول تحلیلی موردنیاز مطالعات پژوهشی را میسازم و تحلیلهای آماری مرتبط را انجام میدهم.
یک دستیار مبتنی بر مدل زبانی به داشبورد مطالعاتمان اضافه کردم تا پژوهشگران بتوانند با زبان طبیعی دادهها را فیلتر کنند. این ابزار هنوز در مرحلهی بتا است و چند پزشک در حال آزمودن آن هستند. در پروژهای دیگر، برای یک پایاننامهی دورهی تخصصی در دانشگاه بولونیا، ابزاری بدون نیاز به کدنویسی برای استخراج داده طراحی کردم تا پزشک بتواند تحلیل دادههای ICU را بدون پیشزمینهی مدیریت داده و بدون نیاز به حضور من در مراحل اجرایی انجام دهد.
بخش مهم دیگری از کارم این است که مشخص کنم دادهها واقعاً تا چه حد میتوانند از یک نتیجه یا فرضیه پشتیبانی کنند؛ مهارتی که در همکاری نزدیک با پزشکان و متخصصان آمار به دست آوردهام.
پیش از پیوستن به ماریو نگری، شش ماه در بریتانیا و در The Openwork Partnership روی تشخیص ناهنجاری در دادههای خدمات مشاورهی مالی تحت مقررات کار کردم. قبل از آن نیز در دانشگاه برگامو دستیار آموزشی درس یادگیری ماشین بودم.
پژوهش
حوزههای اصلی کار پژوهشی من شامل امتیازهای شدت بیماری، کالیبراسیون مدلها و تحلیل دادههای طولی است.
اما پیش از هر تحلیلی، یک چالش اساسی وجود دارد: دادههای بالینی چندمرکزی باید بهاندازهای یکپارچه و قابلمقایسه شوند که اساساً بتوان یک پرسش پژوهشی معتبر از آنها مطرح کرد. بخش زیادی از کار من دقیقاً روی همین مرحله متمرکز است.
تا امروز با دادههای GiViTI و MIMIC کار کردهام.
-
۲۰۲۵
Development and Validation of the Sequential Organ Failure Assessment (SOFA)-2 Score
JAMA, 334(23): 2090–2103
از نویسندگان همکار مقاله. دادهها را از پایگاه دادهی ICU MargheritaTre (GiViTI) استخراج و پردازش کردم و در تحلیلهای آماری و بازبینی مقاله مشارکت داشتم.
-
۲۰۲۵
Anomaly Detection in Financial Advisory Services: A Machine Learning Approach for Mortgage Conduct of Business Advisers
Conference abstract, ICSEM 2025, Ottawa, Canada
توسعهی یک روش تشخیص ناهنجاری بدونناظر برای دادههای مربوط به عملکرد مشاوران وام مسکن در محیطی تحت مقررات. این سیستم با Azure Machine Learning و با هدف پشتیبانی از فرایندهای بررسی انطباق با مقررات توسعه یافت و بر پایهی پایاننامهی کارشناسی ارشد من شکل گرفت.
-
۲۰۲۶
Assessing the Efficacy of a Sequential General Variational Mode Decomposition-Based Combination Model for United States Wind Power Forecasting
Modeling Earth Systems and Environment, 12(2): 74
توسعهی یک مدل ترکیبی مبتنی بر روشهای تجزیه برای پیشبینی سری زمانی تولید برق بادی.
پروژهها
-
از یک پایگاه دادهی پراکندهی ICU تا یک جدول تحلیلی معتبر
توسعهی حدود ۹۰۰ خط SQL در Google BigQuery برای تبدیل یک پایگاه دادهی مراقبتهای ویژه با ساختاری پیچیده و چندجدولی به یک جدول تحلیلی واحد و اعتبارسنجیشده.
این جدول اکنون بهعنوان یکی از منابع استاندارد داده، هم توسط تیمهای مختلف مؤسسه و هم پژوهشگران خارج از آن استفاده میشود. خودکارسازی پردازشهای دورهای و فرایند گزارشگیری نیز حجم قابلتوجهی از کار دستی را در چند پروژه کاهش داده است.
BigQuery · SQL · Python · R
-
توسعهی امتیاز SOFA-2، منتشرشده در JAMA
پایپلاین داده را از پایگاه دادهی ICU MargheritaTre (GiViTI) ساختم: دادههای خام را که بخشی از آنها JSON تودرتو بود استخراج و بازسازی کردم، جدول SOFA-2 را بر اساس قواعد امتیازدهی مطالعه ساختم و رابطهی امتیاز با مرگومیر را تحلیل کردم. بعد در بازبینی مقاله کمک کردم.
مرگومیر در ICU بر حسب امتیاز کل، SOFA-1 در برابر SOFA-2، در روز اول بستری. بازترسیمشده از شکل 3B مقالهی Ranzani و همکاران، JAMA 2025. بهعنوان یکی از نویسندگان همکار در این پژوهش حضور داشتم. این مطالعه حاصل یک همکاری بینالمللی گسترده میان چندین مؤسسهی پژوهشی بود.
امتیازهای شدت بیماری · کالیبراسیون مدل · R · SQL
-
داشبوردی که پژوهشگران میتوانند مستقیماً از آن سؤال کنند
دستیاری مبتنی بر مدل زبانی در داشبورد تحلیلی گروه. درخواستی را که پژوهشگر به زبان طبیعی مینویسد به فیلترهای داشبورد تبدیل میکند تا لازم نباشد کسی برایش کوئری بنویسد. فقط دادههای تجمیعی به مدل بیرونی فرستاده میشود.
هنوز در مرحلهی بتا است و چند پزشک در حال آزمودن آن هستند.
Python · Panel · LangChain · Kimi-K2 · FAISS
-
مهندسی داده برای یک مطالعهی تغذیهدرمانی در ICU
بهعنوان مهندس داده در یک پایاننامهی دورهی تخصصی بیهوشی و مراقبتهای ویژه دربارهی مدیریت تغذیهدرمانی بیماران بدحال بستری در ICU همکاری کردم.
برای این پروژه، یک کاربرگ استخراج دادهی بدون نیاز به کدنویسی طراحی کردم تا پزشک بتواند فرایند تحلیل را مستقیماً اجرا کند؛ بدون اینکه به پیشزمینهای در مدیریت داده یا حضور من در هر مرحله نیاز داشته باشد.
استخراج داده · دادههای ICU · SQL
-
تشخیص ناهنجاری در خدمات مشاورهی مالی تحت مقررات
توسعهی یک سیستم تشخیص ناهنجاری بدونناظر در Azure Machine Learning برای شناسایی الگوهای غیرمعمول در دادههای مربوط به عملکرد مشاوران وام مسکن، با هدف کمک به فرایند بررسی انطباق با مقررات.
پایپلاین Azure ML. دادههای خام جدید پاکسازی و به ویژگی تبدیل میشوند، مدل آنها را امتیازدهی میکند، و مرحلهی آخر مقادیر SHAP و نمودارهای PCA را برای داشبورد Power BI که ناظران با آن کار میکردند محاسبه میکند. همان دادهی جدید دوباره به آموزش برمیگردد تا مدل برای دور بعد آماده باشد. در کنار این سیستم، بیش از ۲۸ شاخص کلیدی کسبوکار را تعریف، محاسبه و اعتبارسنجی کردم. نتایج از طریق داشبوردهای Power BI در اختیار مدیران و ناظران ارشد قرار میگرفت.
روش این مدل بهصورت چکیدهی کنفرانس در ICSEM 2025 ارائه شد.
همچنین پایپلاینهایی با Azure Python SDK و Spark SQL توسعه دادم و همراه یکی از همکارانم روی تبدیل برنامههای قدیمی COBOL به سرویسهای تحت وب و استفاده از هوش مصنوعی در برخی پروژههای منتخب کار کردم.
Azure ML · Python · Spark SQL · Power BI
-
Financial Advisor؛ یک سیستم تصمیمگیری متنباز
یک سیستم محلی برای ارزیابی تصمیمهای مالی خانوار بر اساس شواهد تاریخدار از ۱۳ منبع عمومی، یک سیاست سرمایهگذاری مکتوب و مجموعهای از قواعد کنترلی که در صورت ناکافی بودن شواهد، سقف امتیاز را محدود میکنند.
در این سیستم، ادعایی که دستکم سه منبع مستقل و بهروز از آن پشتیبانی نکنند، بهجای آنکه به یک پاسخ مثبت تبدیل شود، در وضعیت «نامشخص» باقی میماند.
این پروژه با Python و تنها با استفاده از کتابخانهی استاندارد آن توسعه یافته و ۵۵۹ تست دارد. کد پروژه متنباز است و قرارداد مربوط به ارائهدهندگان داده نیز مستند شده تا افراد دیگر بتوانند منابع داده یا حوزههای قضایی جدیدی به آن اضافه کنند. مرور پروژه · مخزن کد
Python · Public APIs · Claude Code
-
پروژههای یادگیری و آزمایش
نگاشت رکوردهای HL7 FHIR R4 به جداول staging با ساختاری مشابه OMOP در Databricks.
یک تمرین کوچک پردازش زبان طبیعی بالینی با spaCy و medspaCy: موجودیتهایی که از یادداشتهای ساختگی استخراج میشوند به ویژگیهایی برای طبقهبندهای ساده تبدیل میشوند.
یک نوتبوک پرسشوپاسخ مبتنی بر بازیابی اطلاعات با LangChain و pgvector که فقط بر اساس متن بازیابیشده پاسخ میدهد.
این پروژهها را برای یادگیری عملی این فناوریها ساختهام، نه برای یک مطالعه یا مشتری مشخص. هیچیک در محیط عملیاتی مورد استفاده قرار نمیگیرند؛ آنها حوزههایی هستند که میخواهم در ادامه بیشتر رویشان کار کنم.
Databricks · spaCy · medspaCy · LangChain · pgvector · FastAPI · Docker · MLflow
مسیر حرفهای
- نوامبر ۲۰۲۴ تا امروزمتخصص علم داده، مؤسسه تحقیقات داروشناسی ماریو نگری، رانیکا، ایتالیا
- دسامبر ۲۰۲۳ تا ژوئن ۲۰۲۴متخصص علم داده، دورهی کارآموزی کارشناسی ارشد (شش ماه)، The Openwork Partnership، سویندون، بریتانیا
- ۲۰۲۱–۲۰۲۴کارشناسی ارشد اقتصاد و تحلیل داده، دانشگاه برگامو
- مارس تا ژوئن ۲۰۲۳دستیار آموزشی درس یادگیری ماشین، دانشگاه برگامو
- ۲۰۲۲رتبهی اول Stat-Hackathon برگامو به همراه تیمم
Python · R · SAS - ۲۰۱۵کارشناسی مدیریت بازرگانی، دانشگاه آزاد اسلامی نیشابور
ابزارها و مهارتها
- زبانهای برنامهنویسی
- Python، R، SQL، Spark SQL
- آمار
- آزمون فرض، مدلسازی رگرسیون، تحلیل دادههای طولی، تحلیل سریهای زمانی، تحلیل چندمتغیره
- یادگیری ماشین
- روشهای باناظر و بدونناظر، تشخیص ناهنجاری، خوشهبندی، مهندسی ویژگی، پردازش زبان طبیعی (NLP)
- زیرساخت ابری و داده
- Google BigQuery، Azure ML، Azure Synapse، Databricks، Power BI
- استقرار و عملیاتیسازی مدلها
- MLflow، FastAPI، Docker، Git، LangChain، Claude Code
- دادههای بالینی
- GiViTI / MargheritaTre، MIMIC، HL7 FHIR R4، OMOP
- زبانها
- فارسی — زبان مادری
انگلیسی — سطح حرفهای، C1
ایتالیایی — A2، در حال آمادگی برای B1
آلمانی — مقدماتی
در تماس باشیم
برای موقعیتهای پژوهشی و صنعتی در سراسر اروپا و همچنین فرصتهای دکتری در حوزهی دادههای سلامت آمادهی همکاری هستم.
[email protected]